基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_025248 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:108614004-108620686 (+) |
| 描述 | Similar to PRIN2: Protein PLASTID REDOX INSENSITIVE 2%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_025248 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g10522 |
参与氧化还原介导的逆行信号,以协调核基因组和质体基因组中光合作用基因的表达,尤其在过量光照条件下。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os09g0382400 |
对质体编码的RNA聚合酶(PEP)的活性和由PEP转录的基因的完全表达是必需的。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.276; 覆盖度=14.758; E 值=4.07e-57; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009642 | response to light intensity | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.276; 覆盖度=14.758; E 值=4.07e-57; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010468 | regulation of gene expression | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.276; 覆盖度=14.758; E 值=4.07e-57; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000427 | plastid-encoded plastid RNA polymerase complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.276; 覆盖度=14.758; E 值=4.07e-57; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042644 | chloroplast nucleoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.276; 覆盖度=14.758; E 值=4.07e-57; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042646 | plastid nucleoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.276; 覆盖度=14.758; E 值=4.07e-57; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.276; 覆盖度=14.758; E 值=4.07e-57; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G10522 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.276; 覆盖度=14.758; E 值=4.07e-57 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os09g0382400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=48.819; 覆盖度=16.158; E 值=1.91e-26 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | zma:100278908 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=57.944; 覆盖度=13.613; E 值=9.65e-28 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |