基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_025209 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:107602827-107606983 (-) |
| 描述 | Similar to AMY3: Alpha-amylase 3%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_025209 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g69830 |
在体外具有内淀粉分解活性，但似乎不需要分解叶子中的瞬时淀粉。 |
alpha-Amylase is not required for breakdown of transitory starch in Arabidopsis leaves.2005 · DOI: 10.1074/jbc.m413638200 Starch granule biosynthesis in Arabidopsis is abolished by removal of all debranching enzymes but restored by the subsequent removal of an endoamylase.2008 · DOI: 10.1105/tpc.108.063487
|
At1g76130 |
可能的 α-淀粉酶似乎不需要分解叶子中的暂时淀粉。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os08g0473600 |
对于萌发过程中胚乳淀粉的分解很重要。 | 暂无已核实直接文献 |
Os09g0457600 |
对于萌发过程中胚乳淀粉的分解很重要。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0005975 | carbohydrate metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=50.754; 覆盖度=44.321; E 值=1.75e-128; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005983 | starch catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.472; 覆盖度=100.891; E 值=0.0; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005987 | sucrose catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.472; 覆盖度=100.891; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.472; 覆盖度=100.891; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=51.01; 覆盖度=44.098; E 值=2.54e-138; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.472; 覆盖度=100.891; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.472; 覆盖度=100.891; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004556 | alpha-amylase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.472; 覆盖度=100.891; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:CACAO | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005509 | calcium ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.472; 覆盖度=100.891; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G69830 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.472; 覆盖度=100.891; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G76130 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=51.01; 覆盖度=44.098; E 值=2.54e-138 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os09g0457500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=48.507; 覆盖度=44.766; E 值=1.49e-125 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |