基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_024202 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:84471593-84473853 (+) |
| 描述 | Similar to RRT1: Rhamnogalacturonan I rhamnosyltransferase 1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_024202 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g15740 |
糖基转移酶参与种皮粘液中鼠李糖半乳糖醛酸 I 寡糖的形成，种皮粘液是一种含有丰富 RG-I 的特殊细胞壁。 | |
At3g02250 |
参与种子外皮黏液中鼠李半乳糖醛酸I（RG-I）低聚糖形成的糖基转移酶，这是具有丰富RG-I的特化细胞壁（通过相似性）。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g14020 |
参与种子外皮黏液中鼠李半乳糖醛酸I（RG-I）低聚糖形成的糖基转移酶，这是具有丰富RG-I的特化细胞壁（通过相似性）。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g03280 |
参与种子外皮黏液中鼠李半乳糖醛酸I（RG-I）低聚糖形成的糖基转移酶，这是具有丰富RG-I的特化细胞壁（通过相似性）。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g37980 |
O-糠基转移酶 19。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006004 | fucose metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.378; 覆盖度=93.333; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010214 | seed coat development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.378; 覆盖度=93.333; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010395 | rhamnogalacturonan I metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.378; 覆盖度=93.333; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045489 | pectin biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.378; 覆盖度=93.333; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071555 | cell wall organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=71.218; 覆盖度=93.333; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000139 | Golgi membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.378; 覆盖度=93.333; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=58.316; 覆盖度=93.137; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.378; 覆盖度=93.333; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=55.889; 覆盖度=91.569; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=48.064; 覆盖度=86.078; E 值=1.64e-137; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008194 | UDP-glycosyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.378; 覆盖度=93.333; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016757 | glycosyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=71.218; 覆盖度=93.333; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G14020 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=58.316; 覆盖度=93.137; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G03280 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=55.889; 覆盖度=91.569; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G37980 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=48.064; 覆盖度=86.078; E 值=1.64e-137 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G02250 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=71.218; 覆盖度=93.333; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G15740 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.378; 覆盖度=93.333; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |