基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_023881 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:72284236-72286592 (+) |
| 描述 | Similar to LYSA1: Diaminopimelate decarboxylase 1%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_023881 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g14390 |
特异性催化中间二氨基庚二酸(meso-DAP)脱羧生成L-赖氨酸。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g11880 |
特异性催化中间二氨基庚二酸(meso-DAP)脱羧生成L-赖氨酸。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os02g0440000 |
特异性催化中间二氨基庚二酸(meso-DAP)脱羧生成L-赖氨酸。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009089 | L-lysine biosynthetic process via diaminopimelate | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.862; 覆盖度=97.239; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.862; 覆盖度=97.239; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=74.85; 覆盖度=98.817; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.862; 覆盖度=97.239; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.862; 覆盖度=97.239; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008836 | diaminopimelate decarboxylase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.862; 覆盖度=97.239; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030170 | pyridoxal phosphate binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=37.288; 覆盖度=81.46; E 值=1.81e-87; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G14390 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.862; 覆盖度=97.239; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G11880 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=74.85; 覆盖度=98.817; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0440000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=77.336; 覆盖度=84.418; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | nme:NMB1976 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=38.609; 覆盖度=82.249; E 值=6.29e-86 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | pae:PA5277 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=37.288; 覆盖度=81.46; E 值=1.81e-87 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |