基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_023636 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:57892456-57899312 (+) |
| 描述 | Similar to GC4: Golgin candidate 4 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_023636 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g46180 |
高尔基体基质蛋白在将囊泡束缚到高尔基体膜和维持高尔基体的整体结构中发挥作用。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g61570 |
高尔基体基质蛋白在将囊泡束缚到高尔基体膜和维持高尔基体的整体结构中发挥作用。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g02260 |
生长素外排和极性生长素转运（PAT）所必需，影响细胞伸长、顶端优势、侧根形成、花序结构及整体生长发育等生长素介导的发育应答。 |
BIG: a calossin-like protein required for polar auxin transport in Arabidopsis.2001 · DOI: 10.1101/gad.905201 Mutations in the huge Arabidopsis gene BIG affect a range of hormone and light responses.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01779.x The auxin transport inhibitor response 3 (tir3) allele of BIG and auxin transport inhibitors affect the gibberellin status of Arabidopsis.2005 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2004.02287.x CRM1/BIG-mediated auxin action regulates Arabidopsis inflorescence development.2007 · DOI: 10.1093/pcp/pcm094
|
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os09g0247700 |
对生长素外排和极性生长素运输（PAT）必需，影响生长素介导的发育反应（如细胞伸长、顶端优势、侧根产生、花序结构、总体生长和发育）（基于相似性）。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006888 | endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.759; 覆盖度=20.803; E 值=1.02e-45; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0007030 | Golgi organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.759; 覆盖度=20.803; E 值=1.02e-45; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.759; 覆盖度=20.803; E 值=1.02e-45; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005768 | endosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=60.927; 覆盖度=21.664; E 值=1.1e-44; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005794 | Golgi apparatus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.759; 覆盖度=20.803; E 值=1.02e-45; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031267 | small GTPase binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.759; 覆盖度=20.803; E 值=1.02e-45; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G46180 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.759; 覆盖度=20.803; E 值=1.02e-45 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G61570 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=60.927; 覆盖度=21.664; E 值=1.1e-44 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |