基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_022804 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:9880488-9881210 (-) |
| 描述 | Similar to ERF2: Ethylene-responsive transcription factor 2 (Nicotiana sylvestris OX%3D4096) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_022804 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.206; 覆盖度=80.833; E 值=2.39e-31; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006952 | defense response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.206; 覆盖度=80.833; E 值=2.39e-31; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009835 | fruit ripening | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=59.756; 覆盖度=34.167; E 值=1.72e-29; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009873 | ethylene-activated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.206; 覆盖度=80.833; E 值=2.39e-31; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.206; 覆盖度=80.833; E 值=2.39e-31; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=60.465; 覆盖度=35.833; E 值=1.02e-27; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.206; 覆盖度=80.833; E 值=2.39e-31; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.206; 覆盖度=80.833; E 值=2.39e-31; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G44840 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=60.465; 覆盖度=35.833; E 值=1.02e-27 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | nsy:104217398 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.206; 覆盖度=80.833; E 值=2.39e-31 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | nta:107769743 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=39.72; 覆盖度=89.167; E 值=2.63e-31 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | nta:107825044 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=50.0; 覆盖度=45.833; E 值=1.8e-28 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |