基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_022544 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:1271640-1272406 (-) |
| 描述 | Similar to RR10: Two-component response regulator ORR10 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_022544 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
当前来源表未检出该物种的同源命中。
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os12g0139400 |
充当参与 His-to-Asp 磷酸中继信号转导系统的响应调节器。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: B8BLZ4 |
充当参与 His-to-Asp 磷酸中继信号转导系统的响应调节器。 | 暂无已核实直接文献 |
Os11g0143300 |
充当参与 His-to-Asp 磷酸中继信号转导系统的响应调节器。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: Q4GZK2 |
充当参与 His-to-Asp 磷酸中继信号转导系统的响应调节器。 | 暂无已核实直接文献 |
Os04g0442300 |
充当参与 His-to-Asp 磷酸中继信号转导系统的响应调节器。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000160 | phosphorelay signal transduction system | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.211; 覆盖度=105.185; E 值=4.86e-20; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.211; 覆盖度=105.185; E 值=4.86e-20; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009735 | response to cytokinin | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=35.211; 覆盖度=105.185; E 值=5.83e-20; UniProt GO evidence=IC:Gramene | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009736 | cytokinin-activated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.211; 覆盖度=105.185; E 值=4.86e-20; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048830 | adventitious root development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=34.884; 覆盖度=95.556; E 值=1.77e-18; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.211; 覆盖度=105.185; E 值=4.86e-20; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | dosa:Os04g0442300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=34.884; 覆盖度=95.556; E 值=1.77e-18 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os11g0143300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=35.211; 覆盖度=105.185; E 值=5.83e-20 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os12g0139400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.211; 覆盖度=105.185; E 值=4.86e-20 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |