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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

示例 TkA01G624900 LXL04_000258 文献示例 LXL04_039733 TkAUNG001940

查询结果

下载当前结果

基因 IDLXL04_021542
当前查询版本OH1004
位置Chr04:132180618-132181091 (+)
描述Similar to LSH6: Protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 6 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021542 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g07090 可能的转录调控因子，通过响应光促进细胞生长作为发育调控因子。 暂无已核实直接文献
At5g58500 可能的转录调控因子，通过响应光促进细胞生长作为发育调控因子。 暂无已核实直接文献
At3g04510 可能的转录调控因子，通过响应光促进细胞生长作为发育调控因子。 暂无已核实直接文献
At2g42610 可能的转录调控因子，通过响应光促进细胞生长作为发育调控因子。 暂无已核实直接文献
At5g28490 可能的转录调控因子，至少在幼苗发育阶段，以依赖光敏色素的方式促进持续红光（cR）、远红光（cFR）和蓝光（cB）条件下的细胞生长。
Overexpression of LSH1, a member of an uncharacterised gene family, causes enhanced light regulation of seedling development.2004 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2003.01993.x

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0009299mRNA transcription生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.143; 覆盖度=89.172; E 值=2.57e-66; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009416response to light stimulus生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.143; 覆盖度=89.172; E 值=2.57e-66; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009637response to blue light生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=66.443; 覆盖度=94.904; E 值=1.99e-61; UniProt GO evidence=IGI:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009826unidimensional cell growth生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=66.443; 覆盖度=94.904; E 值=1.99e-61; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0010114response to red light生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=66.443; 覆盖度=94.904; E 值=1.99e-61; UniProt GO evidence=IGI:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0010218response to far red light生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=66.443; 覆盖度=94.904; E 值=1.99e-61; UniProt GO evidence=IGI:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0090698post-embryonic plant morphogenesis生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.143; 覆盖度=89.172; E 值=2.57e-66; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.143; 覆盖度=89.172; E 值=2.57e-66; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003677DNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.143; 覆盖度=89.172; E 值=2.57e-66; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G07090KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.143; 覆盖度=89.172; E 值=2.57e-66UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT2G42610KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=62.963; 覆盖度=85.987; E 值=3.94e-62UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G04510KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=73.333; 覆盖度=85.987; E 值=1.42e-62UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G28490KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=66.443; 覆盖度=94.904; E 值=1.99e-61UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G58500KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=68.889; 覆盖度=85.987; E 值=1.22e-64UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release