RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

示例 TkA01G624900 LXL04_000258 文献示例 LXL04_039733 TkAUNG001940

查询结果

下载当前结果

基因 IDLXL04_019993
当前查询版本OH1004
位置Chr04:46624807-46627210 (-)
描述Similar to PCMP-E64: Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At1g56570 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源：OH1004 · LXL04_019993 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g56570 推测含五重复肽序列蛋白At1g56570。 暂无已核实直接文献
At2g13600 含五螺旋肽重复的蛋白 At2g13600。 暂无已核实直接文献
At3g49170 可能在胚胎发生中起作用。 暂无已核实直接文献
At4g18750 在叶绿体中的单 RNA 编辑事件中发挥重要作用。
Identification of two pentatricopeptide repeat genes required for RNA editing and zinc binding by C-terminal cytidine deaminase-like domains.2013 · DOI: 10.1074/jbc.m113.485755
At2g29760 参与叶绿体中的RNA编辑事件。
A study of new Arabidopsis chloroplast RNA editing mutants reveals general features of editing factors and their target sites.2009 · DOI: 10.1105/tpc.109.071472

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0009451RNA modification生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.885; 覆盖度=87.031; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009651response to salt stress生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.885; 覆盖度=87.031; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009737response to abscisic acid生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.885; 覆盖度=87.031; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009749response to glucose生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.885; 覆盖度=87.031; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0010182sugar mediated signaling pathway生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=35.714; 覆盖度=89.688; E 值=8.35e-117; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0050832defense response to fungus生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.885; 覆盖度=87.031; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0080156mitochondrial mRNA modification生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=35.714; 覆盖度=89.688; E 值=8.35e-117; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005739mitochondrion细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.885; 覆盖度=87.031; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.885; 覆盖度=87.031; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003723RNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.885; 覆盖度=87.031; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G56570KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.885; 覆盖度=87.031; E 值=0.0UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT2G13600KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=35.714; 覆盖度=89.688; E 值=8.35e-117UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release