基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_018948 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:20320247-20324434 (+) |
| 描述 | Similar to GEP: Probable glutamyl endopeptidase%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_018948 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g47390 |
体外活性丝氨酸型蛋白酶,可作用于LHCII N端。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0307100 |
体外活性丝氨酸型蛋白酶,可作用于LHCII N端。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006508 | proteolysis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=72.537; 覆盖度=97.347; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043171 | peptide catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.061; 覆盖度=20.0; E 值=3.56e-10; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051603 | proteolysis involved in protein catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=25.402; 覆盖度=31.735; E 值=7.55e-10; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=72.537; 覆盖度=97.347; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=21.585; 覆盖度=37.347; E 值=6.4e-09; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=72.537; 覆盖度=97.347; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=72.537; 覆盖度=97.347; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004175 | endopeptidase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=25.402; 覆盖度=31.735; E 值=7.55e-10; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004177 | aminopeptidase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.061; 覆盖度=20.0; E 值=3.56e-10; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004252 | serine-type endopeptidase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=72.537; 覆盖度=97.347; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008239 | dipeptidyl-peptidase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.061; 覆盖度=20.0; E 值=3.56e-10; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042277 | peptide binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.061; 覆盖度=20.0; E 值=3.56e-10; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G47390 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=72.537; 覆盖度=97.347; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | cel:CELE_F44B9.1 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=21.585; 覆盖度=37.347; E 值=6.4e-09 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0307100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=77.358; 覆盖度=86.531; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |