基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_018801 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:18446030-18448534 (-) |
| 描述 | Protein of unknown function |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_018801 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g43770 |
与 AIPP3/BDT1 一起合作,形成一个 BAH-PHD 双价组蛋白读取复合物,能够读取组蛋白 H3 赖氨酸 27 三甲基化(H3K27me3)标记,以调控转录,特别是防止早期开花;促进 AIPP3/BDT1 与 H3K27me3 的结合。 | |
At5g16680 |
与 AIPP2 和 AIPP3/BDT1 一起合作形成一个 BAH-PHD 双价组蛋白识别复合物,能够识别组蛋白 H3 赖氨酸 27 三甲基化(H3K27me3)和低甲基化的 H3K4 组蛋白标记,从而调控转录,特别是防止提前开花;促进 AIPP3/BDT1 与 H3K27me3 的结合。 | |
At3g02890 |
与AIPP3/BDT1和PAIPP2一起,协作形成BAH-PHD双功能组蛋白识别复合物,能够识别组蛋白H3赖氨酸27三甲基化(H3K27me3)和低甲基化H3K4组蛋白标记,以调控转录,特别是防止早期开花;促进AIPP3/BDT1与H3K27me3的结合。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.136; 覆盖度=43.235; E 值=1.01e-25; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0034244 | negative regulation of transcription elongation by RNA polymerase II | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.136; 覆盖度=43.235; E 值=1.01e-25; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045814 | negative regulation of gene expression, epigenetic | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=33.333; 覆盖度=40.588; E 值=1.35e-13; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000028 | regulation of photoperiodism, flowering | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=33.333; 覆盖度=40.588; E 值=1.35e-13; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.136; 覆盖度=43.235; E 值=1.01e-25; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.136; 覆盖度=43.235; E 值=1.01e-25; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042393 | histone binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=33.333; 覆盖度=40.588; E 值=1.35e-13; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0061628 | histone H3K27me3 reader activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=33.333; 覆盖度=40.588; E 值=1.35e-13; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0140566 | histone reader activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.136; 覆盖度=43.235; E 值=1.01e-25; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G43770 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.136; 覆盖度=43.235; E 值=1.01e-25 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G16680 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=33.333; 覆盖度=40.588; E 值=1.35e-13 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |