基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_012159 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:7535625-7537078 (+) |
| 描述 | Similar to SODA: Superoxide dismutase [Mn]%2C mitochondrial (Nicotiana plumbaginifolia OX%3D4092) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_012159 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009793 | embryo development ending in seed dormancy | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=79.039; 覆盖度=100.439; E 值=1.66e-134; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010043 | response to zinc ion | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=79.039; 覆盖度=100.439; E 值=1.66e-134; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019430 | removal of superoxide radicals | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=81.14; 覆盖度=100.0; E 值=9.39e-140; UniProt GO evidence=NAS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=79.039; 覆盖度=100.439; E 值=1.66e-134; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005759 | mitochondrial matrix | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.14; 覆盖度=100.0; E 值=2.87e-141; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=79.039; 覆盖度=100.439; E 值=1.66e-134; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004784 | superoxide dismutase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.14; 覆盖度=100.0; E 值=2.87e-141; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005507 | copper ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=79.039; 覆盖度=100.439; E 值=1.66e-134; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030145 | manganese ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=81.14; 覆盖度=100.0; E 值=2.87e-141; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=81.14; 覆盖度=100.0; E 值=9.39e-140; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G10920 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=79.039; 覆盖度=100.439; E 值=1.66e-134 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | cann:107871142 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=76.754; 覆盖度=100.0; E 值=1.33e-133 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |