基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_009688 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:131253824-131255394 (-) |
| 描述 | Similar to At2g17033: Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g17033 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_009688 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g17033 |
含五重复肽基序蛋白 At2g17033。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g31400 |
通过逆行的质体到细胞核信号参与核基因表达。 |
Signals from chloroplasts converge to regulate nuclear gene expression.2007 · PMID: 17395793 Plastid signals that affect photomorphogenesis in Arabidopsis thaliana are dependent on GENOMES UNCOUPLED 1 and cryptochrome 1.2009 · DOI: 10.1111/j.1469-8137.2008.02729.x
|
At1g18900 |
含五重复肽的蛋白 At1g18900。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g74750 |
五重复蛋白复合含蛋白 At1g74750。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g12100 |
含五肽重复序列的蛋白质 At5g12100，线粒体。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0010019 | chloroplast-nucleus signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=20.2; 覆盖度=87.939; E 值=1.13e-10; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031930 | mitochondria-nucleus signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=20.2; 覆盖度=87.939; E 值=1.13e-10; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=21.814; 覆盖度=89.474; E 值=1.7e-10; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.804; 覆盖度=91.667; E 值=7.15e-140; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=20.2; 覆盖度=87.939; E 值=1.13e-10; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.804; 覆盖度=91.667; E 值=7.15e-140; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=30.201; 覆盖度=32.675; E 值=1.39e-06; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G18900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=21.814; 覆盖度=89.474; E 值=1.7e-10 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G74750 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=20.723; 覆盖度=91.009; E 值=1.49e-08 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G17033 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.804; 覆盖度=91.667; E 值=7.15e-140 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G31400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=20.2; 覆盖度=87.939; E 值=1.13e-10 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G12100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=30.201; 覆盖度=32.675; E 值=1.39e-06 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |