基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_009488 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:127289394-127290120 (-) |
| 描述 | Similar to NRT3.2: High-affinity nitrate transporter 3.2 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_009488 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g24715 |
作为 NTR2.1 的双组分转运蛋白。 | |
At5g50200 |
作为 NTR2.1 的双组分转运蛋白。 |
High-affinity nitrate transport in roots of Arabidopsis depends on expression of the NAR2-like gene AtNRT3.1.2006 · DOI: 10.1104/pp.105.074385 Characterization of a two-component high-affinity nitrate uptake system in Arabidopsis. Physiology and protein-protein interaction.2006 · DOI: 10.1104/pp.106.085209
|
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os02g0595900 |
作为 NTR2.1、NRT2.2 和 NRT2.3 的双组分转运蛋白。 | |
Os04g0480200 |
参与硝酸盐转运。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009611 | response to wounding | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=39.899; 覆盖度=101.02; E 值=1.62e-36; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010167 | response to nitrate | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.195; 覆盖度=86.224; E 值=7.92e-38; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015706 | nitrate transmembrane transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=39.899; 覆盖度=101.02; E 值=1.62e-36; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042128 | nitrate assimilation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.195; 覆盖度=86.224; E 值=7.92e-38; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.195; 覆盖度=86.224; E 值=7.92e-38; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015112 | nitrate transmembrane transporter activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.195; 覆盖度=86.224; E 值=7.92e-38; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G24715 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.195; 覆盖度=86.224; E 值=7.92e-38 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G50200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=39.899; 覆盖度=101.02; E 值=1.62e-36 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0595900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=42.105; 覆盖度=87.245; E 值=6.71e-34 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os04g0480200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=39.865; 覆盖度=75.51; E 值=7.28e-28 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |