基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_006413 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:10275235-10276250 (+) |
| 描述 | Similar to TB1: Transcription factor TB1 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_006413 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
当前来源表未检出该物种的同源命中。
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0706500 |
可能的转录因子,作为侧枝负向调控因子,可能通过其在腋芽中的表达发挥作用。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.291; 覆盖度=79.845; E 值=2.34e-28; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009799 | specification of symmetry | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=53.103; 覆盖度=56.202; E 值=7.94e-25; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009908 | flower development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=53.103; 覆盖度=56.202; E 值=7.94e-25; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048262 | determination of dorsal/ventral asymmetry | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=53.103; 覆盖度=56.202; E 值=7.94e-25; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048831 | regulation of shoot system development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.291; 覆盖度=79.845; E 值=2.34e-28; UniProt GO evidence=IMP:Gramene | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000032 | regulation of secondary shoot formation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.291; 覆盖度=79.845; E 值=2.34e-28; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.291; 覆盖度=79.845; E 值=2.34e-28; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.291; 覆盖度=79.845; E 值=2.34e-28; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043565 | sequence-specific DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.291; 覆盖度=79.845; E 值=2.34e-28; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | dosa:Os03g0706500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.291; 覆盖度=79.845; E 值=2.34e-28 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4333856 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.291; 覆盖度=79.845; E 值=2.34e-28 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |