基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_005450 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:164316524-164317785 (+) |
| 描述 | Similar to HSF8: Heat shock factor protein HSF8 (Solanum lycopersicum OX%3D4081) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_005450 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g32330 |
转录调控因子,特异性结合 DNA 序列 5'-AGAAnnTTCT-3',该序列称为热休克启动子元件(HSE)。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g17750 |
特异性结合 DNA 序列 5'-AGAAnnTTCT-3' 的转录激活剂,称为热休克启动子元件 (HSE)。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0854500 |
转录调控因子,特异性结合热休克启动子元素(HSE)的DNA。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.732; 覆盖度=76.738; E 值=6.49e-118; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006357 | regulation of transcription by RNA polymerase II | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=76.763; 覆盖度=64.439; E 值=3.42e-116; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009408 | response to heat | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=68.498; 覆盖度=72.995; E 值=3.18e-115; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0034605 | cellular response to heat | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.732; 覆盖度=76.738; E 值=6.49e-118; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.732; 覆盖度=76.738; E 值=6.49e-118; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=68.498; 覆盖度=72.995; E 值=3.18e-115; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000978 | RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.732; 覆盖度=76.738; E 值=6.49e-118; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=61.246; 覆盖度=77.273; E 值=2.37e-108; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.732; 覆盖度=76.738; E 值=6.49e-118; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G32330 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=68.498; 覆盖度=72.995; E 值=3.18e-115 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G17750 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=61.246; 覆盖度=77.273; E 值=2.37e-108 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0854500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=69.198; 覆盖度=63.369; E 值=9.37e-113 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | sly:101263626 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.732; 覆盖度=76.738; E 值=6.49e-118 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |