基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_005429 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:163774262-163780377 (-) |
| 描述 | Similar to FCA: Flowering time control protein FCA (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_005429 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 18 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g16280 |
在促进营养分生长顶端分生组织向生殖发育转变中起主要作用。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g03457 |
RNA结合蛋白参与开花时间的调节。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g03110 |
RNA结合蛋白参与开花时间的调节。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: B8BCZ8 |
在促进营养分生组织向生殖发育转变中起主要作用(通过相似性)。 | 暂无已核实直接文献 |
Os09g0123200 |
在促进营养分生长顶端分生组织向生殖发育转变中起主要作用。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000398 | mRNA splicing, via spliceosome | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=66.537; 覆盖度=33.507; E 值=1.82e-101; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008361 | regulation of cell size | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=66.537; 覆盖度=33.507; E 值=1.51e-101; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009553 | embryo sac development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.842; 覆盖度=105.867; E 值=1.39e-144; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009793 | embryo development ending in seed dormancy | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.842; 覆盖度=105.867; E 值=1.39e-144; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009908 | flower development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.842; 覆盖度=105.867; E 值=1.39e-144; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009909 | regulation of flower development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.842; 覆盖度=105.867; E 值=1.39e-144; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030154 | cell differentiation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.842; 覆盖度=105.867; E 值=1.39e-144; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031048 | regulatory ncRNA-mediated heterochromatin formation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.842; 覆盖度=105.867; E 值=1.39e-144; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048510 | regulation of timing of transition from vegetative to reproductive phase | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=66.537; 覆盖度=33.507; E 值=1.82e-101; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0080113 | regulation of seed growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=66.537; 覆盖度=33.507; E 值=1.51e-101; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000785 | chromatin | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.842; 覆盖度=105.867; E 值=1.39e-144; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.842; 覆盖度=105.867; E 值=1.39e-144; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005681 | spliceosomal complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=66.537; 覆盖度=33.507; E 值=1.82e-101; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.842; 覆盖度=105.867; E 值=1.39e-144; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016604 | nuclear body | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.842; 覆盖度=105.867; E 值=1.39e-144; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1990904 | ribonucleoprotein complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.842; 覆盖度=105.867; E 值=1.39e-144; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.842; 覆盖度=105.867; E 值=1.39e-144; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.842; 覆盖度=105.867; E 值=1.39e-144; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G16280 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=43.842; 覆盖度=105.867; E 值=1.39e-144 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os09g0123200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=66.537; 覆盖度=33.507; E 值=1.82e-101 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |