基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_005238 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:158185638-158188119 (+) |
| 描述 | Similar to At5g03795: Probable glycosyltransferase At5g03795 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_005238 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 13 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g03795 |
可能参与细胞壁生物合成。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g07620 |
可能参与细胞壁生物合成。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g25310 |
可能参与细胞壁生物合成。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: Q9LFP3 |
可能参与细胞壁生物合成。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g33290 |
参与果胶生物合成。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009101 | glycoprotein biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.367; 覆盖度=83.239; E 值=4.54e-101; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010398 | xylogalacturonan metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=42.618; 覆盖度=67.608; E 值=2.15e-89; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045489 | pectin biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=42.618; 覆盖度=67.608; E 值=2.15e-89; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071555 | cell wall organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.367; 覆盖度=83.239; E 值=4.54e-101; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000139 | Golgi membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.367; 覆盖度=83.239; E 值=4.54e-101; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.367; 覆盖度=83.239; E 值=4.54e-101; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005768 | endosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=42.618; 覆盖度=67.608; E 值=2.15e-89; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005794 | Golgi apparatus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=42.618; 覆盖度=67.608; E 值=2.15e-89; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005802 | trans-Golgi network | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=42.618; 覆盖度=67.608; E 值=2.15e-89; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=42.618; 覆盖度=67.608; E 值=2.15e-89; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016757 | glycosyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.367; 覆盖度=83.239; E 值=4.54e-101; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0035252 | UDP-xylosyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=42.618; 覆盖度=67.608; E 值=2.15e-89; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0102983 | xylogalacturonan beta-1,3-xylosyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=42.618; 覆盖度=67.608; E 值=2.15e-89; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G03795 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.367; 覆盖度=83.239; E 值=4.54e-101 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G11130 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=41.643; 覆盖度=66.478; E 值=3.72e-90 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G25310 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.717; 覆盖度=85.122; E 值=2.17e-94 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G33290 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=42.618; 覆盖度=67.608; E 值=2.15e-89 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |