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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDLXL04_004840
当前查询版本OH1004
位置Chr01:148526705-148528353 (+)
描述Similar to NFYA10: Nuclear transcription factor Y subunit A-10 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_004840 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 13 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g06510 通过识别并结合启动子中的CCAAT基序,刺激多种基因的转录。 暂无已核实直接文献
At3g05690 通过识别并结合启动子中的CCAAT基序来刺激各种基因的转录(通过相似性)。 暂无已核实直接文献
At1g72830 通过识别并结合启动子中的CCAAT基序,刺激多种基因的转录。 暂无已核实直接文献
At1g30500 通过识别并结合启动子中的CCAAT基序,刺激多种基因的转录。 暂无已核实直接文献
At2g34720 通过识别并结合启动子中的CCAAT基序,刺激多种基因的转录。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006351DNA-templated transcription生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.61; 覆盖度=97.468; E 值=6.27e-44; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0006355regulation of DNA-templated transcription生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=43.346; 覆盖度=83.228; E 值=2.18e-42; UniProt GO evidence=ISS:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0006357regulation of transcription by RNA polymerase II生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.61; 覆盖度=97.468; E 值=6.27e-44; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009408response to heat生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=43.346; 覆盖度=83.228; E 值=2.18e-42; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009567double fertilization forming a zygote and endosperm生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=43.346; 覆盖度=83.228; E 值=2.18e-42; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0045892negative regulation of DNA-templated transcription生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=55.556; 覆盖度=34.177; E 值=1.97e-29; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0045893positive regulation of DNA-templated transcription生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=43.346; 覆盖度=83.228; E 值=2.18e-42; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0048510regulation of timing of transition from vegetative to reproductive phase生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=50.0; 覆盖度=34.177; E 值=3.03e-27; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.61; 覆盖度=97.468; E 值=6.27e-44; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016602CCAAT-binding factor complex细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.61; 覆盖度=97.468; E 值=6.27e-44; UniProt GO evidence=IEA:InterProUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0000981DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.61; 覆盖度=97.468; E 值=6.27e-44; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003677DNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.61; 覆盖度=97.468; E 值=6.27e-44; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003700DNA-binding transcription factor activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.61; 覆盖度=97.468; E 值=6.27e-44; UniProt GO evidence=ISS:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G30500KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=55.556; 覆盖度=34.177; E 值=1.97e-29UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G72830KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=35.841; 覆盖度=71.519; E 值=7.9e-30UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT2G34720KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=50.0; 覆盖度=34.177; E 值=3.03e-27UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G05690KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=43.346; 覆盖度=83.228; E 值=2.18e-42UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G06510KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.61; 覆盖度=97.468; E 值=6.27e-44UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release