基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_004684 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:143326604-143329913 (-) |
| 描述 | Similar to PARP3: Protein ADP-ribosyltransferase PARP3 (Glycine max OX%3D3847) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_004684 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g22470 |
参与碱基切除修复(BER)途径,通过催化有限数量参与染色质结构和DNA代谢的受体蛋白的多聚ADP-核糖化。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os02g0530600 |
参与碱基切除修复(BER)途径,通过催化有限数量参与染色质结构和DNA代谢的受体蛋白的多聚ADP-核糖化。 | 暂无已核实直接文献 |
Os07g0413700 |
参与碱基切除修复(BER)途径,通过催化有限数量参与染色质结构和DNA代谢的受体蛋白的多聚ADP-核糖化。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006302 | double-strand break repair | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.377; 覆盖度=98.533; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0070212 | protein poly-ADP-ribosylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=31.955; 覆盖度=97.555; E 值=5.62e-108; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=66.296; 覆盖度=99.022; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005730 | nucleolus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.377; 覆盖度=98.533; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.377; 覆盖度=98.533; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003950 | NAD+ poly-ADP-ribosyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.377; 覆盖度=98.533; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.377; 覆盖度=98.533; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016779 | nucleotidyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.377; 覆盖度=98.533; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051287 | NAD binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=31.955; 覆盖度=97.555; E 值=5.62e-108; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0140806 | NAD+-protein-aspartate ADP-ribosyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.377; 覆盖度=98.533; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:RHEA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0140807 | NAD+-protein-glutamate ADP-ribosyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.377; 覆盖度=98.533; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:RHEA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1990404 | NAD+-protein mono-ADP-ribosyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.377; 覆盖度=98.533; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G22470 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=65.217; 覆盖度=98.411; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0530600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=58.395; 覆盖度=99.022; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os07g0413700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=31.955; 覆盖度=97.555; E 值=5.62e-108 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | gmx:548024 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.377; 覆盖度=98.533; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |