基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_004351 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:133261096-133263772 (+) |
| 描述 | Similar to EIX1: Receptor-like protein EIX1 (Solanum lycopersicum OX%3D4081) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_004351 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g71400 |
参与CLV3及CLV3样肽的感知,这些肽作为调节分生组织维护的细胞外信号。 | |
At5g46330 |
构成模式识别受体(PPR),决定对鞭毛蛋白(flg22)的特异性识别,flg22是引发对病原相关分子模式(PAMPs)防御反应的有效诱导因子。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os04g0576900 |
在器官发育的早期阶段通过调节细胞分裂速率发挥功能。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0002220 | innate immune response activating cell surface receptor signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.082; 覆盖度=90.327; E 值=1.67e-113; UniProt GO evidence=EXP:PHI-base | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0007165 | signal transduction | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.258; 覆盖度=97.362; E 值=3.73e-75; UniProt GO evidence=IC:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009742 | brassinosteroid mediated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.455; 覆盖度=95.854; E 值=3.6e-76; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010073 | meristem maintenance | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.258; 覆盖度=97.362; E 值=3.73e-75; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0050832 | defense response to fungus | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.082; 覆盖度=90.327; E 值=1.67e-113; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0090696 | post-embryonic plant organ development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.455; 覆盖度=95.854; E 值=3.6e-76; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.258; 覆盖度=97.362; E 值=3.73e-75; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.082; 覆盖度=90.327; E 值=1.67e-113; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004672 | protein kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.455; 覆盖度=95.854; E 值=3.6e-76; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.455; 覆盖度=95.854; E 值=3.6e-76; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G71400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.258; 覆盖度=97.362; E 值=3.73e-75 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os04g0576900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.455; 覆盖度=95.854; E 值=3.6e-76 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4336741 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.455; 覆盖度=95.854; E 值=3.6e-76 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | sly:543900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=39.082; 覆盖度=90.327; E 值=1.67e-113 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |