基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_003694 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:94819942-94821483 (-) |
| 描述 | Similar to FRL4A: FRIGIDA-like protein 4a (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_003694 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 4 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g22440 |
FRIGIDA样蛋白 4a。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g14900 |
FRIGIDA 样蛋白 4b。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g48385 |
FRIGIDA 样蛋白 3。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g16320 |
对FRI介导的FLC转录上调是必需的,但与FRI不冗余,仅与FRL2部分冗余。 |
FRIGIDA-related genes are required for the winter-annual habit in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1073/pnas.0306778101
|
UniProt: A0SWL0 |
参与开花时间的调控。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009908 | flower development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=27.907; 覆盖度=100.638; E 值=1.36e-43; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030154 | cell differentiation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=27.907; 覆盖度=100.638; E 值=1.36e-43; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=27.907; 覆盖度=100.638; E 值=1.36e-43; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009536 | plastid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.522; 覆盖度=61.915; E 值=3.16e-24; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G22440 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=27.907; 覆盖度=100.638; E 值=1.36e-43 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G14900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=27.602; 覆盖度=94.043; E 值=3.3e-41 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G16320 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=24.211; 覆盖度=60.638; E 值=3.25e-13 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G48385 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.522; 覆盖度=61.915; E 值=3.16e-24 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |