基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_003485 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:80942504-80944520 (+) |
| 描述 | Protein of unknown function |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_003485 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g55760 |
优先与高度有序的 α-葡聚糖结合,例如淀粉和结晶麦芽糖糊精。 | |
At1g42430 |
优先与高度有序的 α-葡聚糖结合,例如淀粉和结晶麦芽糖糊精。 |
The Starch Granule-Associated Protein EARLY STARVATION1 Is Required for the Control of Starch Degradation in Arabidopsis thaliana Leaves.2016 · DOI: 10.1105/tpc.16.00011
|
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: A2XC52 |
优先结合高度有序的α-葡聚糖,如淀粉和结晶麦芽糊精(通过相似性推测)。 | 暂无已核实直接文献 |
Os03g0133300 |
优先结合高度有序的α-葡聚糖,如淀粉和结晶麦芽糊精(通过相似性推测)。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0005982 | starch metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.742; 覆盖度=97.982; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009958 | positive gravitropism | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=46.324; 覆盖度=49.908; E 值=9.69e-55; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009959 | negative gravitropism | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=40.857; 覆盖度=64.22; E 值=1.31e-60; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032948 | regulation of alpha-glucan metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=46.324; 覆盖度=49.908; E 值=6.27e-55; UniProt GO evidence=IEA:EnsemblPlants | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048316 | seed development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=46.324; 覆盖度=49.908; E 值=9.69e-55; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000904 | regulation of starch metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.742; 覆盖度=97.982; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.742; 覆盖度=97.982; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.742; 覆盖度=97.982; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.742; 覆盖度=97.982; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043036 | starch grain | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.742; 覆盖度=97.982; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2001070 | starch binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.742; 覆盖度=97.982; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G42430 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=45.756; 覆盖度=49.725; E 值=2.17e-54 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G55760 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.742; 覆盖度=97.982; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0133300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=46.324; 覆盖度=49.908; E 值=9.69e-55 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |