基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_002196 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:43694778-43700148 (+) |
| 描述 | Similar to TRP6: Telomere repeat-binding protein 6 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_002196 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g53790 |
与植物端粒双链 DNA 序列特异性结合。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g07540 |
与植物端粒双链 DNA 序列特异性结合。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g13820 |
特异性结合植物端粒双链 DNA 序列 5'-TTTAGGG-3'。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g46590 |
与植物端粒双链 DNA 序列特异性结合。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os02g0817800 |
结合端粒双链5'TTTAGGG-3'重复序列,并调节端粒长度和结构。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000723 | telomere maintenance | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=34.579; 覆盖度=17.286; E 值=2.58e-09; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.909; 覆盖度=14.216; E 值=6.1e-11; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032204 | regulation of telomere maintenance | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=40.909; 覆盖度=14.216; E 值=8.78e-10; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000781 | chromosome, telomeric region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=40.909; 覆盖度=14.216; E 值=8.78e-10; UniProt GO evidence=IC:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.909; 覆盖度=14.216; E 值=6.1e-11; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=34.579; 覆盖度=17.286; E 值=2.58e-09; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003691 | double-stranded telomeric DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=34.579; 覆盖度=17.286; E 值=2.58e-09; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008301 | DNA binding, bending | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=33.945; 覆盖度=17.609; E 值=3.91e-09; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042162 | telomeric DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.909; 覆盖度=14.216; E 值=6.1e-11; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042803 | protein homodimerization activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=40.909; 覆盖度=14.216; E 值=8.78e-10; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G07540 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=37.931; 覆盖度=14.055; E 值=8.6e-10 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G46590 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=33.945; 覆盖度=17.609; E 值=3.91e-09 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G53790 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.909; 覆盖度=14.216; E 值=6.1e-11 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G13820 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=34.579; 覆盖度=17.286; E 值=2.58e-09 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0817800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=40.909; 覆盖度=14.216; E 值=8.78e-10 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |