基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_002016 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:39613217-39614045 (+) |
| 描述 | Similar to ATS3B: Embryo-specific protein ATS3B (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_002016 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009793 | embryo development ending in seed dormancy | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=44.262; 覆盖度=71.345; E 值=1.99e-29; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000325 | plant-type vacuole | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.0; 覆盖度=98.246; E 值=6.22e-55; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.0; 覆盖度=98.246; E 值=6.22e-55; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=44.262; 覆盖度=71.345; E 值=1.99e-29; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009506 | plasmodesma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=52.98; 覆盖度=88.304; E 值=8.23e-53; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009536 | plastid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.0; 覆盖度=98.246; E 值=6.22e-55; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.0; 覆盖度=98.246; E 值=6.22e-55; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G41475 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=52.98; 覆盖度=88.304; E 值=8.23e-53 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G07190 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=44.262; 覆盖度=71.345; E 值=1.99e-29 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G62200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.0; 覆盖度=98.246; E 值=6.22e-55 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |