基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_000846 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:15592947-15595124 (-) |
| 描述 | Similar to PRT1: E3 ubiquitin-protein ligase PRT1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_000846 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 1 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g24800 |
E3 泛素蛋白连接酶，介导靶蛋白的泛素化和随后的蛋白酶体降解。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006511 | ubiquitin-dependent protein catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.48; 覆盖度=101.937; E 值=3.43e-89; UniProt GO evidence=TAS:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016567 | protein ubiquitination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.48; 覆盖度=101.937; E 值=3.43e-89; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043161 | proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.48; 覆盖度=101.937; E 值=3.43e-89; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0050832 | defense response to fungus | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.48; 覆盖度=101.937; E 值=3.43e-89; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071596 | ubiquitin-dependent protein catabolic process via the N-end rule pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.48; 覆盖度=101.937; E 值=3.43e-89; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000151 | ubiquitin ligase complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.48; 覆盖度=101.937; E 值=3.43e-89; UniProt GO evidence=TAS:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.48; 覆盖度=101.937; E 值=3.43e-89; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004842 | ubiquitin-protein transferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.48; 覆盖度=101.937; E 值=3.43e-89; UniProt GO evidence=TAS:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.48; 覆盖度=101.937; E 值=3.43e-89; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0061630 | ubiquitin protein ligase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.48; 覆盖度=101.937; E 值=3.43e-89; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G24800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.48; 覆盖度=101.937; E 值=3.43e-89 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |